O primeiro passo, é pararmos o MySQL com o comando abaixo:
# /etc/init.d/mysql stop
Depois devemos iniciar o MySQL em modo de segurança, para que possamos ter acesso para alterar a senha:
# mysqld_safe --skip-grant-tables --skip-networking &
Explicando:
O parâmetro --skip-grant-tables, serve para o MySQL iniciar sem o responsável pela verificação das permissões dos usuários, dando permissão total a todos os usuários.
O segundo parâmetro --skip-networking, serve para que nenhuma conexão TCP/IP seja aceita, evitando que alguém se aproveite deste tempo para "destruir" seu banco de dados.
Uma vez o banco desprotegido, vamos conectar e alterar a senha do usuário que queremos recuperar. Neste exemplo, vou usar o próprio root:
# mysql -u root
mysql> update mysql.user set password=PASSWORD('nova_senha') where user='root';
mysql> flush privileges;
A senha do root já está alterada. Agora devemos parar o MySQL e iniciá-lo novamente, para que o MySQL inicie sem os skips:
# /etc/init.d/mysql stop
# /etc/init.d/mysql start
Agora, para testarmos, vamos conectar ao banco usando a senha que colocamos:
# mysql -u root -p'nova_senha'
Referência: http://www.vivaolinux.com.br/dica/Recuperando-senha-MySQL
